Cerita tentang seorang siswa SMA bernama Kei Nagai, yang tertangkap dalam kecelakaan lalu lintas, dan meninggal, tapi langsung hidup kembali dan sadar bahwa dia bukan manusia, tapi Ajin, makhluk misterius yang tidak bisa mati. Karena ketakutan, dia melarikan diri dari manusia tetapi dibantu oleh temannya Kai, yang bergabung dengan dia dalam bukunya melarikan diri dari peradaban. Dia kemudian menjadi terlibat dalam konflik antara manusia dan Ajin, di pihak manakah dia harus berada?
